En un comunicado, el ex alcalde Rudy Giuliani dijo que estará eternamente agradecido por la ayuda que Egan prestó a las familias de los fallecidos en el atentado a las Torres Gemelas.
Por su parte, el exacalde Michael Bloomberg, dijo en un comunicado, "Lideró la iglesia durante tiempos difíciles y ayudó a Nueva York a salir de uno de sus momentos más oscuros. Siempre podía contar con su apoyo a nivel personal, aún cuando nuestros puntos de vista eran muy diferentes".
Aún no se han hecho públicos detalles para los servicios fúnebres del cardenal, pero se conoce que sus restos descansarán en la cripta bajo la Catedral de San Patricio.